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Logo após a morte de São Francisco juntou-se uma multidão vinda de todos os lados para dar o último adeus ao santo.

Apesar de toda a tristeza, muitos louvores eram entoados agradecendo a Deus pelo dom de sua vida. Deste modo, parecia mais estar havendo a celebração de uma solene e festiva liturgia.

No dia seguinte, 4 de outubro de 1226, quando amanheceu, a multidão munida de ramos e velas levou o corpo em cortejo para dentro da cidade de Assis. Ao passarem na frente do mosteiro de São Damião – onde Santa Clara e as irmãs clarissas moravam -, resolveram proporciona-lhes a alegria de ver pela última vez o santo Pai Francisco. Vale lembrarmos aqui que Francisco, numa certa ocasião já bem próximo da morte, havia mandado dizer a Clara que ela ainda o veria uma última vez. Bem, deste modo, a profecia se cumpriu.

Depois, levaram o corpo para a igreja de São Jorge, para sepultá-lo. Atualmente esta igreja é a basílica dedicada a Santa Clara. Nela, Francisco aprendeu as primeiras letras quando criança e foi lá também que fez a sua primeira pregação.