Depois que se curou, São Francisco começou a passar horas em solidão diante do Crucifixo da abandonada igreja de são Damião, que estava em ruínas. Perguntava a Cristo: “-Senhor, que queres que eu faça????” Até que um dia percebeu que Ele lhe respondia: “-Vai, Francisco! Reconstrói a minha Igreja!”
Assim, no ano de 1205 Francisco começou se desfazer dos ricos tecidos que seu pai vendia e começou a distribui-los entre os pobres. Vendeu também o seu lindo cavalo. Deu o dinheiro aos pobre e a um padre pobre da região. Seu pai, vendo isso, ficou furioso e quis o seu dinheiro de volta. Arrastou-o, então, até a presença do Bispo de Assis, Dom Guido.